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蘇州發(fā)現(xiàn)奧密克戎新分支?專家:憑測(cè)序相似程度判斷為時(shí)過早

蘇州發(fā)現(xiàn)奧密克戎新分支?專家:憑測(cè)序相似程度判斷為時(shí)過早

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人工智能朗讀:

4月2日,蘇州市疾控中心在疫情發(fā)布會(huì)上介紹,該市發(fā)現(xiàn)奧密克戎BA.1.1進(jìn)化分支,在多個(gè)數(shù)據(jù)庫中均未發(fā)現(xiàn)新冠病毒基因組高度同源序列。“如果你去回溯德爾塔毒株,會(huì)發(fā)現(xiàn)它有很多分支AY.1、AY.2……AY.133,但最后成為主流的只有幾個(gè)。

4月2日,蘇州市疾控中心在疫情發(fā)布會(huì)上介紹,該市發(fā)現(xiàn)奧密克戎BA.1.1進(jìn)化分支,在多個(gè)數(shù)據(jù)庫中均未發(fā)現(xiàn)新冠病毒基因組高度同源序列。

國內(nèi)出現(xiàn)了此前未有的奧密克戎新變異?這個(gè)變異如何出現(xiàn)?新冠病毒是不是又進(jìn)化了?疫情還防不防得住?

盡管蘇州市疾控中心強(qiáng)調(diào),需要一定時(shí)間來分析比對(duì)才能公布進(jìn)一步信息。但這個(gè)新變異仍引起了廣泛關(guān)注和不少猜測(cè),登上熱搜。帶著上述問題,科技日?qǐng)?bào)記者連線采訪了國家級(jí)數(shù)據(jù)平臺(tái)的一位病毒學(xué)專家。

僅憑測(cè)序相似程度判斷為時(shí)過早

“‘未發(fā)現(xiàn)高度同源的序列’,這樣的說法不夠科學(xué)。”該專家表示,首先,該報(bào)道想表述的意思應(yīng)該是“高度相似的序列”,在生物進(jìn)化研究中,“同源”只能被描述為“是”或者“否”;其次,“高度”的含義不夠精確,99.9%和99%都可能被認(rèn)為是“高度”,但是這兩個(gè)相似性之間的差異引起的序列數(shù)量變化高達(dá)200多個(gè)核苷酸;最后,基因組序列變化并不意味著病毒的傳播力、感染力、致病力等必然會(huì)發(fā)生變化,不能僅僅根據(jù)序列差異數(shù)量判斷是否出現(xiàn)新的流行變異株,而應(yīng)進(jìn)一步分析序列變異有沒有引起對(duì)應(yīng)氨基酸的變化,這個(gè)變異又發(fā)生在哪個(gè)蛋白上,如果是重要蛋白是否在關(guān)鍵區(qū)域。只有這些都研究清楚了,才能夠知道新的毒株可能產(chǎn)生的后果。

是否為“新分支”目前尚不確定

蘇州市疾控中心通報(bào)中提到,發(fā)現(xiàn)奧密克戎變異株BA.1.1進(jìn)化分支,是不是說明已經(jīng)變異到一定程度了呢?

“對(duì)于新冠病毒的新分支,國際上有不同的定義。”該專家對(duì)科技日?qǐng)?bào)記者表示,有的定義比較粗放、有的比較細(xì)致。學(xué)術(shù)界有不同的分類方法,設(shè)立了不同的標(biāo)準(zhǔn)。

科技日?qǐng)?bào)記者查詢文獻(xiàn)資料了解到,有學(xué)者在分析了35000多條新冠病毒基因組信息后,在2020年7月提出了動(dòng)態(tài)命名的方法 “PANGO”,其他學(xué)者也提出過不同的分類方法。

以較為廣泛應(yīng)用的“PANGO”法為例,該方法規(guī)定:一個(gè)新的子分支,必須有充分系統(tǒng)發(fā)育證據(jù),證明后代譜系在某個(gè)不同地理區(qū)域人群中的流行過程中從祖先譜系向后代譜系的進(jìn)化過程,也就是說子分支必須有實(shí)質(zhì)性地向前傳播。目前而言,僅從一位感染者中檢測(cè)到該變異序列,難以證實(shí)其有實(shí)質(zhì)性地向前傳播,因此不一定能被定義為新分支。

“新分支”不足為奇,有可能“自生自滅”

“此輪本土疫情已經(jīng)持續(xù)了一個(gè)多月了,按照新冠病毒的變異速度,出現(xiàn)2個(gè)左右的變異是正常的。”該專家表示,但并不是說新冠病毒一出現(xiàn)新分支就都會(huì)變成厲害的變異株,只有比較“適應(yīng)”的病毒才有可能存活下來,即便存活下來,也未必會(huì)發(fā)展成為主流毒株。

“如果你去回溯德爾塔毒株,會(huì)發(fā)現(xiàn)它有很多分支AY.1、AY.2……AY.133,但最后成為主流的只有幾個(gè)。”該專家解釋,大量的分支在流行的過程中“自生自滅”。因此,即便是出現(xiàn)一個(gè)新的分支,那也無需過度恐慌,分支最后未必會(huì)形成主流,也很少會(huì)發(fā)展為更具感染力和致病性的毒株。

重要的是大量采集當(dāng)前各地新冠陽性人員樣本進(jìn)行病毒基因組測(cè)序,通過生物信息學(xué)方法密切監(jiān)測(cè)變異情況,及時(shí)發(fā)現(xiàn)主流毒株,研發(fā)有效的疫苗、抗病毒藥物和檢測(cè)試劑,實(shí)現(xiàn)對(duì)疫情的防控。

(原標(biāo)題《蘇州發(fā)現(xiàn)奧密克戎新分支?專家:憑測(cè)序相似程度判斷為時(shí)過早》)

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